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          生物資訊

          Nat. Biotechnol.:計(jì)算機(jī)可操控酵母菌內(nèi)特定基因開關(guān)

          作者:劉霞 來(lái)源:科技日?qǐng)?bào) 發(fā)布時(shí)間: 2011-11-14 08:53  瀏覽次數(shù):
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          據(jù)英國(guó)廣播公司(BBC)11月6日?qǐng)?bào)道,瑞士科學(xué)家在最新一期《自然—生物技術(shù)》雜志撰文指出,他們成功地在計(jì)算機(jī)和普通釀酒酵母之間形成了一個(gè)“反饋環(huán)”,可用計(jì)算機(jī)精確地控制酵母菌內(nèi)特定基因的打開和關(guān)閉,這項(xiàng)創(chuàng)新方法可對(duì)利用微生物制造生物燃料或抗體等生物過程進(jìn)行精確控制。

           

          該研究的領(lǐng)導(dǎo)者、瑞士聯(lián)邦理工學(xué)院蘇黎世分校自動(dòng)化研究所所長(zhǎng)約翰·萊格熱斯表示,在最新研究中,計(jì)算機(jī)通過控制閃光可打開和關(guān)閉某個(gè)特定基因的表達(dá),讓該基因“學(xué)會(huì)”達(dá)到和維持一個(gè)給定值。這是一種相對(duì)比較簡(jiǎn)單的方法,能讓科學(xué)家們很好地控制復(fù)雜的生物化學(xué)過程來(lái)得到滿意的結(jié)果。此前已有很多科學(xué)家嘗試過其他方法,比如在細(xì)胞內(nèi)部給細(xì)胞編碼讓其成為電路,或?qū)⒒蚍湃爰?xì)胞內(nèi)等,然而結(jié)果都差強(qiáng)人意。

          萊格熱斯和同事用釀酒酵母開始實(shí)驗(yàn),釀酒酵母在現(xiàn)代分子和細(xì)胞生物學(xué)中一般被用作真核模式生物,供科學(xué)家進(jìn)行各種生物實(shí)驗(yàn)。2002年,一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)釀酒酵母暴露于光線下時(shí),其體內(nèi)一種名為光敏素的分子會(huì)發(fā)生變化:紅光讓其處于“活躍狀態(tài)”,而遠(yuǎn)紅光又會(huì)將其變回穩(wěn)定態(tài),這表明光敏素的活動(dòng)能讓制造給定蛋白的基因機(jī)制打開或關(guān)閉。

          萊格熱斯研究團(tuán)隊(duì)使用上述技巧來(lái)確保當(dāng)釀酒酵母制造特定蛋白時(shí),會(huì)將相應(yīng)的基因打開;使用一個(gè)在發(fā)射熒光過程中自身能發(fā)光的“信使”分子也能追蹤這種酵母菌的“一舉一動(dòng)”。他們制造出了一個(gè)控制環(huán):當(dāng)紅光照射時(shí),可追蹤有多少個(gè)酵母細(xì)胞正在表達(dá)該基因;也可用遠(yuǎn)紅光來(lái)抑制這種基因表達(dá)。該研究團(tuán)隊(duì)還研發(fā)出了一個(gè)計(jì)算機(jī)模型,以追蹤每次光照應(yīng)持續(xù)多長(zhǎng)時(shí)間才能精確地讓特定數(shù)量的基因表達(dá)得以維持。

          科學(xué)家們表示,最新研究表明,生命內(nèi)精確而微妙的生物機(jī)制能被用于很多實(shí)驗(yàn)中,這些實(shí)驗(yàn)有助于我們更好地理解細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)機(jī)制。最新研究還有望應(yīng)用于生物燃料或抗體的制造過程中,通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)來(lái)增加產(chǎn)量。

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