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          生物資訊

          細菌耐藥機理及其耐藥細菌的檢測與臨床

          作者:admin 來源:本站 發(fā)布時間: 2011-02-27 21:31  瀏覽次數(shù):
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          一、全球面臨主要細菌耐藥問題
          •  MRS(Methicilln-Resistant Stapylococci) 耐甲氧西林葡萄球菌包括MRSA,MRSE等。
          •  VIA(Vancomycin-Intermediate Staphyococcus Aurus) 萬古霉素中介的金葡菌
          •  VRE(Vancomycin-Resitant Enterococci) 萬古霉素耐藥的腸球菌
          •  ESBL(Extended-Spectrum B-lactamse) 超廣譜酶(大腸/肺克)
          •  Inducible Ampc (Ampc基因突變,高產(chǎn)量,50%左右三代頭孢耐藥) 陰溝、產(chǎn)氣、聚團等腸桿菌屬。
          •  Non-Fementatives(非發(fā)酵菌) 銅綠、不動、嗜麥芽
          •  PRP(Penicillin-Resistant S、P) 青霉素耐藥的肺炎球菌。
          耐藥的主要機理
          •  .產(chǎn)生滅活酶 .靶位改變 低通性屏障作用(膜通透性下降及生物被膜) .主動外運
          •  .細胞缺乏自溶酶,對抗菌藥物產(chǎn)生耐受性
          對各類抗生素的主要耐藥機制
          •  抗菌藥物   耐藥機制  
          •  β-內(nèi)酰胺類  細胞壁通性降低,與PBPs親和力與結合力降低,產(chǎn)B-內(nèi)酰胺酶,自溶  
          •  氨基甙類  攝入減少,產(chǎn)鈍化酶,核糖體30S亞基改變,EH下降和PH下降,降低氨基甙活性  
          •  大環(huán)內(nèi)脂類  核糖體50S亞基改變,局部PH下降可降低活性  
          •  四環(huán)素類  藥物外流加快,細菌體內(nèi)積蓄減少,核糖體30S亞基 改變,產(chǎn)生滅活酶  
          •  氯霉素  攝入減少,產(chǎn)生氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶  
          •  林可類  核糖體50S亞基改變  
          •  萬古霉素  不易產(chǎn)生耐藥性  
          •  喹諾酮類  細胞外膜OMPF降低,攝入減少,膜傳導通道改變胞內(nèi)積蓄減少等
          產(chǎn)生滅活酶是最多見的耐藥機制,可通過細菌的基因突變引起,最主要是從其他細菌通過轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導,結合,異位而獲得。最主要的滅活酶有二類:一類為ß-內(nèi)酰胺酶,另一類為氨基甙類鈍化酶。
          一、β-內(nèi)酰胺酶:
          •   主要分類方法有二種 a.分子生物學分類:根據(jù)末端氨基酸序列及編碼基因位點(見圖1)
          •  b.功能分類:根據(jù)酶等電點、水解底物、是否被酶抑制劑所抑制及分子結構類別(見表1表2)
          表一 1998年Bush分類
          ß -內(nèi)酰胺酶種類   克拉維酸、舒巴坦作用
          •  Group1:頭孢菌素酶 (誘導酶) 不能抑制
          •  Group2a:青霉素酶 能抑制
          •  Group2b:廣譜酶 能抑制
          •  Group2b’:超廣譜酶 能抑制
          •  金屬酶:   不能抑制
          超廣譜ß -內(nèi)酰胺酶(Estended-spectrum ß -latamases,ESBLs)
          ESBLs是質(zhì)粒介導的,為TEM-1,TEM-2和SHV-1的突變酶,包括TEM-3到TEM-26,SHV-2SHV-6共近30種,與TEM-1,TEM-2和SHV-1相比,僅有1到4個氨基酸的不同,由在分子質(zhì)粒編碼的,質(zhì)粒分子量大約在23Kbs到100Kbs之間,能夠被棒酸所抑制,屬于A類酶(分子生物學分類),可以通過結合試驗轉(zhuǎn)給敏感菌,1983年,歐洲KnotheH在肺炎克雷轉(zhuǎn)給敏感菌,1983年,歐洲KnotheH在肺炎克雷伯桿菌中發(fā)現(xiàn)了這種能滅活三代頭孢菌素的SHV-1衍生物,現(xiàn)已在英國引起多次的醫(yī)院感染爆發(fā)流行。
          產(chǎn)ESBLs菌株的耐藥特點:廣譜酶(TEM-1,TEM-2,SHV-1)主要滅活青霉素和窄譜頭孢菌素(一、二代頭孢),三代頭孢菌素對其穩(wěn)定,而ESBLs能分解三代頭孢(頭孢噻肟、頭孢他啶、頭孢哌酮、頭孢曲松)以及單環(huán)酰胺類的氨曲能,但大多數(shù)產(chǎn)ESBLs菌株對復合三代頭孢(如舒普深)敏感,幾乎所有ESBLs菌株對泰能敏感。
          產(chǎn)ESBL菌株的治療
          •  碳青霉烯類   首選藥物  
          •  β-內(nèi)酰胺類 首選有效(必須給予相當高的劑量)
          抗生素與β-內(nèi)酰胺酶抑制劑 復合制劑
          •  喹諾酮類 如果藥敏結果顯示敏感則可
          氨基糖甙類 能有效 SMZco(復方新諾明)
          產(chǎn)ESBL菌株的治療
          •  至今,有證據(jù)建議:經(jīng)驗治療可能產(chǎn)ESBLs株導致的感染必須包括一個碳青霉烯類抗生素聯(lián)合應用一個氨基糖甙類抗生素,直到細菌敏結果知道時。
           
           
           根據(jù)臨床藥敏報告進行推測 對多種三代頭孢菌素耐藥的需考慮產(chǎn)ESBL有可能(現(xiàn)在有一種共識即若確定為產(chǎn)ESBL菌株,即使普通三代頭孢及氨曲能藥敏是敏感的也要報耐藥)。
          適用于治療ESBL株的抗生素藥 碳青霉烯類 復合三代頭孢菌素(但需劑量大一點,注意Ampc基因) 
          阿米卡星(不同地區(qū)可不一致)
          幾種新的ß-內(nèi)酰胺酶
          耐酶抑制劑廣譜酶(IRT,IRBLs,18種)
          水解氨芐西林、羧芐西林,對哌拉西林和頭孢類仍敏感 
          克拉維酸、舒巴坦的抑制效果不好,舒巴坦對IRT最差
          他唑巴坦仍有抑制作用 哌拉西林/他唑巴坦復方仍有活性作用
          酶抑制劑:1克拉維酸、舒巴坦、他唑巴坦. 2.TEM型 三種均有抑制作用,作用相仿
          3.SHV型 他唑巴坦、克拉維酸強于舒巴坦 4.產(chǎn)酶細菌對酶抑制劑不敏感的原因
          1)TEM-1產(chǎn)量過多 2)外膜蛋白改變 3)1型酶(AmpC)
          4)1 2 型酶并存 5)2br(IRT) 6)2d(OXA-11)
          TYPE β-Lac
          概述:產(chǎn)生機制 染色體上的amp(通常處于被抑制狀態(tài)) 突變 去阻遏活化編碼產(chǎn)生AmpC酶
          誘導機制 BPBs4,7a,7b(Sanders CC,1977)
          近來還發(fā)現(xiàn)質(zhì)粒介導的AmpC酶
          來源:染色體上的AmpC轉(zhuǎn)移到質(zhì)粒,使ECO和KPN的臨床分離株獲得質(zhì)粒介導的AmpC酶。
          此外可見于:Salmonella spp ,P.Mirabilis.C.freundii。
          染色體上的基因來自腸桿菌屬、枸櫞酸桿菌屬和假單胞菌屬。
          已報告17種,其中出現(xiàn)最多、分布最廣的是CMY-2
          特點: 往往在抗生素治療過程中誘導產(chǎn)生,并有可能選擇出持續(xù)、大量產(chǎn)酶的耐藥菌株(去阻遏突變株)
          ?  IMP是許多潛在的酶誘導劑之一,但沒有選擇去阻遏突變株的作用。
          ?  許多3-ceph是弱誘導劑,但有選擇去阻遏突變株的作用。
          臨床意義:隨著新型頭孢菌素的使用增加,能產(chǎn)生type1 β-Lac,導致對β-內(nèi)酰胺類多重耐藥的菌株迅速出現(xiàn)并成為醫(yī)院感染的重要病原菌。
          ?  ICU和灼傷等重癥患者對腸桿菌、沙雷菌和銅綠假單胞菌等能產(chǎn)生TYPE 1β-Lac的細菌高度易感,成為上述病區(qū)的嚴重問題。
          ?  只有嚴格控制三代頭孢菌素的使用,才能控制這一嚴重問題。
          治療: 碳青霉烯類 四代頭孢菌素:頭孢吡肟、頭孢匹羅
          小結:1.AmpC酶(Bush1型酶)可引起GNB對三代頭孢菌素和單酰胺類抗生素的耐藥。對抑制劑不敏感,對IMP敏感。2.AmpC酶具有一定的誘導性3.AmpC酶不僅可由染色體且可由質(zhì)粒介導。4.AmpC表達的調(diào)控機制未明,據(jù)認為與ampR、ampD、ampE、ampG有關。
          氨基糖甙類鈍化酶
          1.氨基糖甙類抗生素對鈍化酶穩(wěn)定性不同,耐藥率不同 2.慶大穩(wěn)定性較差,耐藥率高
          3.阿米卡星、奈替米星穩(wěn)定性高,耐藥率低 4.尤其是奈替米星,對50%以上的慶大藥株有效
          •  氨基甙類鈍化酶:磷酸轉(zhuǎn)移酶、乙酰轉(zhuǎn)移酶、核苷轉(zhuǎn)移酶
          氯霉素乙?;?紅霉素-O-磷酸化酶;克林霉素-O-核苷化酶.
          二、靶位改變
          (1)原有靶位的親和力改變 PRP:PBP1a,2a,2b,2x的親和力下降,造成對青霉素及頭孢菌素耐藥
          (2)出現(xiàn)新的替代途徑 8TKDa----PBP1---- 80 ----PBP2----PBP2a(PBP,278Kda)
          75 ----PBP,3---- 70 ----PBP3---- 41 ----PBP4----
          (3)任何抗菌藥物均可由靶位改變產(chǎn)生耐藥。
          三、.低通透性屏障作用
          (1)外膜通透性降低
          a.孔蛋白(Porin)組成及數(shù)量改變有關大腸埃希菌OmpF和OmpC (耐藥OmpF下降)
          b.D2微孔蛋白(47KDa)
          (2)生物被膜(Biofilm)的形成
          a.BF組成:多糖基質(zhì)、纖維蛋白、脂蛋白等
          b.BF與細菌耐藥 休眠狀態(tài),膜通透性下降; BF屏障作用 BF吸附滅活菌
          BF吸附抗菌藥物 BF使細菌獲得足夠時間,開啟耐藥基因
          四、主動外運
          操縱于MexA-MexB-OprM編號的三種蛋白組成的復合體。
          MexA-40KD質(zhì)膜蛋白(膜融合蛋白) MexB-108KD主動外運蛋白 OprM-50KD外膜蛋白 
          四、細菌耐藥性的變遷
          細菌耐藥性隨著時代的變遷,其中最重要的一個原因是抗藥藥物的濫用,篩選出耐藥株,并增加細菌突變的壓力。因此必須了解細菌耐藥狀況,選擇合理抗菌藥物進行治療。
           
          五、常見細菌耐藥及治療
          (一)肺炎球菌(鏈球菌屬的問題)
          注意青霉素耐藥問題(國內(nèi)約5%)
          (1)青霉素MIC測定
          敏感   中介(低耐)用   耐藥  .
          MIC≤0.06mg/L   0.12∽1mg/L   ≥2mg/L 
          (2)耐藥機理: 未發(fā)現(xiàn)產(chǎn)B-內(nèi)酰胺酶菌株 耐藥是由于靶位改變即PBP2b,2x親和力下降
          (3)治療 大劑量青霉素 高劑量阿莫西林 頭孢噻肟 頭孢曲松 萬古(去甲萬古) 利福平
          (二)耐甲氧西林葡萄球菌(MRS)
          •  定 義:耐甲氧西林、耐苯唑西林且多重耐藥的葡萄球菌。
          •   耐藥機理:MecA編碼PBP2a及PBPs改變。
          •   意義:對目前所有的β-內(nèi)酰胺類耐藥,通常對氨基甙類、大環(huán)內(nèi)酯類、克林霉素和四環(huán)素多重耐藥。
          •   治療:1.MRS輕度感染 利福平 ,SMZ- TMP,環(huán)丙沙星; 2.MRS嚴重全身感染 首選萬古霉素
          (三)、腸球菌
          注意是否對慶大霉素高耐,是否耐萬古霉素。
          (1)慶大高耐:慶大MIC≥1000mg/L 萬古耐藥:萬古MIC≥4mg/L
          萬古耐藥方式:VanA(萬古、替考拉寧R), VanB (萬古R,替考拉寧S) 
          (2)耐藥機理: 慶大高耐:產(chǎn)APH (2,)-AAC (6,)氨基甙鈍化酶耐萬古:粘肽結構靶位改變(D-丙氨酰-D-丙氨酸被D-丙氨酰-D乳酸取代)
          (3)治療 基本治療方式是青霉素或氨芐西林+慶大霉素。
          慶大高耐:需用萬古或去甲萬古,有時加用利福平。 萬古耐藥:目前尚無有效治療方法。
          VanA:非R,非氨基甙高R 青或氨芐+慶大:青R,非氨基甙高R 頭孢曲松+慶大,環(huán)丙沙星+慶大
          VanB:非氨基甙高R 替考拉寧+慶大霉素, 氨基甙高R 替考拉寧+氟喹諾酮
          多重耐藥腸球菌 鏈陽菌素(Streptogramin)
          注意事項:腸球菌對頭孢菌素、氨基甙類、克林霉素和TMP/SMZ可在體外顯示活性但臨床無效。因此上述藥物在此禁止使用。
          (四)銅綠假單胞菌
          膜通透性低,生物被膜,產(chǎn)生各種滅活酶及主動外排系統(tǒng)對許多抗菌藥物自然耐藥,僅下列藥物可供選擇: 哌拉西林、特美汀、他唑西林、頭孢哌銅、舒普深、頭孢他啶、氨曲能、泰能、 環(huán)丙沙星、氧氟沙星、奈替米星、阿米卡、妥布霉素。 可單用或聯(lián)合應用上述藥物。
          從國內(nèi)外耐藥調(diào)查的資料看,對綠膿桿菌作用最強的是泰能與頭孢他啶,且泰能與其它抗)銅綠假單胞菌藥物間一般不會出現(xiàn)交叉耐藥,是由于)銅綠假單胞菌對泰能的耐藥主要是碳青霉烯類的特異通道(47KD的D2微孔蛋白)的關閉和金屬酶的產(chǎn)生。
          (五)大腸桿菌和肺克
          產(chǎn)各種B-內(nèi)酰胺酶比例幾乎為100%,成對B-內(nèi)酰胺抗生素不同程度耐藥。
          1)產(chǎn)青霉素酶:分解阿模西林或青霉素等,用復合青霉素等。
          2)頭孢菌素酶:主要分解的是一.二代頭孢,一.二代頭孢大多耐藥,加酶抑制劑能逆轉(zhuǎn),三代頭孢.頭霉素敏感。
          3)廣譜酶(TEM-1,2,SHV-1):分解青霉素類、二代頭孢,能被酶抑制逆轉(zhuǎn)
          4)ESBL(超廣譜酶):能分解青霉素類、頭孢菌素類及氨曲,一旦確定為產(chǎn)ESBL,青霉素類,頭孢類及氨曲南均報耐藥,主要出現(xiàn)在院內(nèi)感染菌株。
          2.再了解一下國外對三代頭孢耐藥的大腸與肺克的相關資料
          CAZ-R的克雷伯菌菌血癥的危險因素
          特點  血中分離菌  
             CAZ-R(31)CAZ-S(31)  P7  
          養(yǎng)老院住戶   15   3   0.009  
          封閉導尿管    25   5   <0.00001  
          G+J管   14   1   0.0004  
          中心靜脈插管   27  11   0.0001  
          事先用過抗生素   20   8   0.001  
          頭孢他啶或胺曲南 11   0   0.009  
          CAZ-R克雷伯菌的交叉耐藥
             1990   1993  
          慶大/妥布   62%   73%  
          喹諾酮   39.8%   51.8%  
          在CAZ-S克雷伯菌   <5%   <5%
          這種高發(fā)的交叉耐藥性是這種細菌難于治療的原因之一。例如,在1993年,耐頭孢他啶的克雷伯菌中,73%的菌株耐慶大霉素或妥布霉素,而超過半數(shù)的菌株耐喹諾酮類。相反,在對頭孢他啶敏感的克雷伯菌中,同時兩個藥的耐藥率都很低。
          在72小時菌血癥期間,在適當治療和無適當治療的帶有頭孢他啶耐藥的病人的結局.很多情況下我們很難證實細菌的MIC值與所選用抗生不比療效之間具有明確的關系。但是這項研究,此關系得到證實,因為在這些耐頭孢他啶的菌癥病人中,適當治療的結局要比后來證實為不適治療的結局好。在適當治療病人中,18/19存活;相反,事后證實為不適當治療即使用了三代頭孢菌的病人中,5/12人死亡,2組間具有顯著差異。適治療組使用的亞胺培南聯(lián)合或不聯(lián)合氨基糖甙類。整篇文章證明,碳青霉烯類抗生素是治療ESBL的最好藥物。
           
           
           四代頭孢:頭孢吡肟/頭孢匹羅對I型酶高活性是由于:快速穿過外膜蛋白對I型酶穩(wěn)定對PBP高親和力但許多產(chǎn)ESBL的菌株耐四代頭孢菌素,所以用它們治療產(chǎn)ESBL株的感染是不安全的。
          六、志賀菌屬、沙門菌屬
          •  注意:不應報告選用一、二代頭孢及氨基糖甙類,因為體外實驗可表現(xiàn)有活性,但臨床無效。
          八、嗜麥芽窄食單孢菌
          •  對泰能天然耐藥,可供選擇的有:SMZco,阿米卡星,特美丁,喹諾酮類。
          九、不動桿菌
          對一、二代頭孢,半合成廣譜青霉素,慶大霉素耐藥率達70-80%,對三代頭孢菌素可達50%,但這是條件致病菌,一般出現(xiàn)于院內(nèi)感染,主要是三代頭孢選擇壓力產(chǎn)生。治療上至少選用復合三代頭孢,但以泰能、阿米卡星、環(huán)丙沙星敏感率較高。
          十、腸桿菌屬細菌
          主要包括陰溝、聚團、產(chǎn)氣腸桿菌的菌種。
          重要耐藥G-菌產(chǎn)I型B-內(nèi)酰胺酶(誘導酶)
          •  100%  綠膿桿菌   100%  吲哚(+)變形桿菌   80%   腸桿菌屬  
          •  80%   枸櫞酸菌屬   80%   沙雷菌屬  
          腸桿菌屬及其它腸桿菌科細菌
          一   對氨芐西林耐藥率55-94%,氨芐西林+舒巴坦耐藥率為12.6-73%。腸桿菌科細菌對頭孢唑啉耐藥率為36-48%,但摩根菌屬,枸櫞酸菌屬、普通變形桿菌耐藥率高達80-100%,對頭孢呋辛耐藥率為30-50%,腸桿菌屬、沙雷菌屬、枸櫞酸菌屬幾乎100%耐藥,治療上需選氨基糖甙類、碳青霉烯類(如:泰能)、氟喹諾酮等。
          耐藥的出現(xiàn)與頭孢菌素、氨基糖甙類,亞胺培南和其他Beta-內(nèi)酰胺類的治療的關系:
          抗生素治療   治療后耐藥性的出現(xiàn)率n/N(%)  
          •  三代頭孢   6/31(19)  
          •  氨基糖甙類  1/89(1)  
          •  亞胺培南   0/17(0)  
          •  其它   0/33(0)
          這類菌株三代頭孢菌素使用后出現(xiàn)耐藥較高,而認為三代頭孢不適當應用于腸桿菌屬細菌的嚴重感染。
          從細菌耐藥情況可以得出如下結論
          1. 多重耐藥G+感染在增加,尤其是耐萬古霉素菌株的出現(xiàn)和比例的上升是面臨的嚴峻問題。
          2.多重耐藥G-正在醫(yī)院,特別是危重病人增加,給臨床治療造成困難。
          3.這種情況的出現(xiàn)主要是由于抗G-桿菌藥物,尤其是三代頭孢菌素及其它口服抗菌藥物的濫用造成的。
          4.多重耐藥G+感染的最有效藥物仍是萬古霉素,多重耐藥G-桿菌的最有效藥物是碳青霉烯類。

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